Sammanfattning
Shinji Ikari går på NERV Foundation Academy och lever ett liv i relativ normalitet. En natt möter han Rei Ayanami och Kaworu Nagisa som flyr från platsen för en våldsam explosion och blir så småningom rekryterad för att hjälpa dem och Asuka Sohryuu Langely i kampen mot änglarna, som har antagit mänsklig form, för att få tillbaka deras kärnor för att stödja världsträdet , Yggdrasil. Skulle Yggdrasil dö, skulle deras värld kastas in i ett kaotiskt tillstånd där parallella strömmar av existens kolliderar, vilket så småningom leder till att allting förstörs. — Mangauppdateringar