Historien fortsätter där den första säsongen slutade bara månader in i framtiden. Yuokai Gakuen har reparerats och den nya terminen är igång. Tsukune och gänget är tillbaka, och kraftfullare än någonsin. Anti-Thesis sanna identitet är lättad. Med nya motståndare på väg vid horisonten, och något mycket mer olycksbådande än gänget någonsin har mött tidigare.
Tsukune kämpar med monstret inom sig. Med hjälp av Moka, Mizore, Kurumu, Ruby och Yukari. Tsukune tränar för att få sitt vampyrblod under kontroll och styrkan att skydda det han håller kärt.
Den nya säsongen fokuserar mer på tjejerna, deras förflutna och deras familjer. Nya konfrontationer väntar dem. Nya vänner och allierade kommer att ansluta sig till dem vid deras sida. Tillsammans kommer de att upptäcka hemligheterna bakom Mokas radband och hennes härstamning...
